А, бе забоди го този ОУ на една платка и пробвай на живо.
Wise е прав. ако го захранваш от +-5V, най вероятно симулатора ти паказва насещане на изхода. Пробвай на по-високо захранване и виж какво показва.

Стига бе, тъкмо свикнах с тоя протеус и почнах да се кефя, че няма да си горя пръстите повече.
Иначе с само с +5 правоъгълни импулси дава същото.

А бе увеличи захранващото напрежение на поне +-8V пък тогава кажи какво става.
Всички станаха модерни .

Ами сложих го 8V, и отгоре се оправи. Но от долу пак има разлика 500 mV.

Е-е-е ... Той симулатора помага, но в кошара не вкарва.
Толкова приказки, искри даже прехвърчаха и ... нищо.
Предлагам ти два варианта - или темата да се заключи като тривиална, или да обясниш какво искаш да правиш.
Ами, че LM358 е проектиран специално за еднополярно захранване.
Подай преднапрежение на входа (0.5*Vcc), подай сигнала през разделителен кондензатор. Сложи такъв на изхода. Захрани с напрежение няколко волта над очакваното Vр-р на входа и тогава виж какво става.
Какви са тези аджамийски истории джанъм!