От една схема мисля, че не можеш да направиш 2 платки. Можеш, ако схемата ти е разделена на 2 sheet в общ проект, след което да генерираш netlist от 2-та sheet-a поотделно. 2-те платки си ги правиш в отделни PCB файлове, след като ги завършиш правиш 3-ти PCB, в който копираш и пастваш всичко от предишните 2 PCB-та. Ако започнеш двете платки в 1-но PCB, не можеш да направиш DRC проверките, тъй като за тях се изисква затворен контур в KeepOut слоя. На практика във всички платкаджийници размножават платките за да се съберат по няколко броя в една заготовка. Ако това ти си го правиш, понякога се създават проблеми, затова е по-добре да съобразиш размерите на твоята платка с размерите на заготовките след което в платкаджийницата да поискаш да размножат така платката, както ти желаеш.
Всъщност от една схема можеш да направиш и N платки в едно PCB, като схемата ти е в един sheet, но това е предпоставка за грешки.